

Killing Floor 2'de oyuncular, Zed salgınının hızla yayıldığı ve durdurulamaz bir ivme kazandığı Avrupa'ya iniyor. Orijinal Killing Floor'daki olayların sona ermesinden sadece bir ay sonra, klonlar her yerde ve medeniyet kargaşa içinde; hükümetler çöktü ve askeri güçler gitti.
KILLING FLOOR 2'de oyuncular, Horzine şirketi tarafından yaratılan Zeds adı verilen korkunç, öldürücü klonlar tarafından istila edilen kıta Avrupa'sına iniyorlar. Horzine Biotech'in başarısız deneylerinin neden olduğu Zed salgını durdurulamaz bir hızla hızla yayıldı ve Avrupa Birliği'ni felç etti. Yalnızca bir ay önce, orijinal KILLING FLOOR'dan gelen ilk Zed salgını Londra'yı kasıp kavurdu; artık örnek klonlar her yerde. Medeniyet kargaşa içinde, iletişim ağları başarısız oldu, hükümetler çöktü ve askeri güçler sistematik olarak ortadan kaldırıldı. Avrupa halkı artık kendini korumaya odaklanmış durumda; hayatta kalan şanslı birkaç kişi saklanmak zorunda kaldı. Ancak herkes umudunu yitirmiş değil; Sivillerden, askerlerden ve paralı askerlerden oluşan çok çeşitli bir grup, Avrupa çapında özel olarak finanse edilen üslerden gelen salgınlarla mücadele etmek için bir araya geldi. Bir örnek klon salgını tespit edildiğinde oyuncular, gerekli her türlü yöntemi kullanarak tüm tehditleri yok etmek için Zed yüklü sıcak bölgelere gönderilir.