

Görünüşte boş bir laboratuvarda uyanan oyuncu, yeni Aperture Science El Tipi Portal Cihazını nasıl, neden veya kim tarafından yapıldığına dair bir açıklama olmaksızın test etmek için çok sayıda test odası aracılığıyla çeşitli fizik tabanlı bulmaca zorluklarını tamamlamak zorunda kalıyor.
Portalın konusu, oyuncuya GLaDOS'tan sesli mesajlar veya "duyurular" ve sonraki seviyelerde bulunan odaların içindeki görsel öğeler yoluyla açıklanır. Portal 2'nin Son Saatleri'ne göre yıl, Aperture Science'ın terk edilmesinden on iki yıl sonra, "2010'da bir yerde" olarak belirlendi. Oyun, Chell'in hareketsiz bir yataktan uyanması ve yapay zeka olan GLaDOS'tan yaklaşan testlerle ilgili talimat ve uyarıları duymasıyla başlıyor. Chell, oyuncuları oyunun mekaniğini sırayla tanıtan farklı odalara giriyor. GLaDOS'un duyuruları Chell'e talimat görevi görür ve oyuncunun oyunda ilerlemesine yardımcı olur, aynı zamanda atmosferi geliştirir ve yapay zekayı bir kişi olarak karakterize eder. Chell'e, tüm test odalarını tamamlaması halinde ödül olarak pasta sözü verildi. Chell, tek etkileşimi GLaDOS ile boş Zenginleştirme Merkezinde ilerliyor. Oyuncu tamamlamaya yaklaştıkça, GLaDOS'un amaçları ve davranışları daha da kötüleşiyor; Cesaret verici görünmek için tasarlanmış olmasına rağmen, GLaDOS'un eylemleri ve konuşması, test deneklerinin güvenliği ve refahı konusunda samimiyetsiz ve duyarsız bir umursamazlık izlenimi veriyor. Chell ilerledikçe test odaları giderek daha tehlikeli hale geliyor; testler, askeri androidler için tasarlanmış canlı atış kursunun yanı sıra bazı odaların tehlikeli bir sıvıyla dolup taşmasını da içeriyor. Başka bir odada GLaDOS, Chell'in testi tamamlamasına yardımcı olmak için her yüzünde tek bir büyük pembe kalp bulunan, bel yüksekliğinde bir sandık olan Weighted Companion Cube'un önemine dikkat çekiyor. Ancak GLaDOS, Chell'in devam edebilmesi için "acil durum istihbarat yakma fırınında" ötenazi yapılması gerektiğini açıkladı. Daha sonraki bazı odalarda, Chell'e ateş eden, yalnızca yok edildikten veya devre dışı bırakıldıktan sonra ona sempati duyan çocuksu seslere (aynı zamanda McLain tarafından seslendirildi) sahip otomatik taretler bulunur. Chell son test odasını tamamladıktan sonra GLaDOS, onu öldürmek amacıyla Chell'i bir çöp yakma fırınına yönlendirir. Chell, portal silahıyla kaçar ve Zenginleştirme Merkezi'ndeki bakım alanlarına doğru ilerler. GLaDOS paniğe kapılır ve testin bir parçası olarak Chell'i öldürüyormuş gibi davrandığı konusunda ısrar eder. GLaDOS daha sonra Chell'den yüz üstü yere yatarak "parti eskort teslim pozisyonunu" üstlenmesini ister, böylece bir "parti ortağı" onu ödülüne götürebilir, ancak Chell kaçmaya devam eder. Bu bölümde, yapay zekanın merkezdeki herkesi öldürdüğü anlaşıldığında GLaDOS, Chell ile iletişim kuruyor. Chell, bakım alanları ve odaların arkasındaki boş ofis alanlarından geçiyor, bazen doğru yönü gösteren grafiti mesajlarını takip ediyor. Son derece harap bir durumda olan bu sahne arkası alanları, bozulmamış test odalarıyla tam bir tezat oluşturuyor. Duvar yazısı, "pasta bir yalan" gibi ifadeler ve Emily Dickinson'ın "The Chariot" şiiri, Henry Wadsworth Longfellow'un "The Reaper and the Flowers" ve Emily Brontë'nin "No Coward Soul Is Mine" adlı şiirinden Companion Cube'a atıfta bulunan ve onun ölümüne gönderme yapan pastişler içeriyor. Chell bakım alanlarının derinliklerine doğru ilerlerken GLaDOS, fiziksel zarar verme tehditleri ve yanıltıcı ifadelerle Chell'i caydırmaya çalışıyor. Chell, GLaDOS donanımının başının üstünde asılı olduğu büyük bir odaya ulaşır. GLaDOS, Chell'i tehdit etmeye devam ediyor, ancak takas sırasında GLaDOS'tan bir küre düşüyor ve Chell onu bir çöp yakma fırınına bırakıyor. GLaDOS, Chell'in, AI'nın zenginleştirme merkezini nörotoksin gazıyla doldurmasının ardından Aperture Science çalışanlarının kurduğu çoklu "kişilik çekirdeklerinden" biri olan ahlak çekirdeğini veya vicdanını yok ettiğini ortaya koyuyor. Kaldırıldığında yayıcılarına tekrar erişebilir. Chell, GLaDOS'un kişilik çekirdeklerinden daha fazlasını yerinden çıkarıp yaktığında altı dakikalık bir geri sayım başlarken, GLaDOS onu hem sözlü olarak, alay hareketleri ve çocukça hakaretlerle hem de fiziksel olarak ona roketler ateşleyerek cesaretini kırıyor. Chell son kişilik çekirdeğini de yok ettikten sonra, bir arıza odayı parçalara ayırır ve her şeyi yüzeye taşır. Chell daha sonra tesisin kapılarının dışında GLaDOS kalıntılarının ortasında yatarken görülüyor. Portal 2'nin duyurulmasının ardından, son daha sonraki bir güncellemeyle genişletildi. Bu geriye dönük süreklilikte Chell, robotik bir sesle konuşan görünmeyen bir varlık tarafından olay yerinden uzaklaştırılır ve ona "parti eskortu teslim pozisyonunu" üstlendiği için teşekkür eder. Tesisin iç kısımlarına uzun ve hızlı bir yakınlaştırmanın ardından gelen son sahne, bir Kara Orman pastasını ve görünüşte aktif olmayan düzinelerce kişilik çekirdeğini içeren bir dizi rafla çevrelenmiş Ağırlıklı Companion Cube'u gösteriyor. Robotik bir kol aşağıya inip pastanın üzerindeki mumu söndürüp odanın kararmasına neden olmadan önce çekirdekler yanmaya başlıyor. Krediler geldikçe GLaDOS bir sonuç raporu sunar: deneyin büyük bir başarı olduğunu ilan eden "Still Alive" şarkısı, aynı zamanda oyuncuya GLaDOS'un hala hayatta olduğunu ve "mutlu" çekirdeğinin devre dışı bırakılmadığını göstermeye hizmet eder.